Главная монастырская церковь – св. Богородицы (1211-1222 гг.) – купольное сооружение с десятью полукруглыми нишами в алтаре (отсюда и название «Хоранашат», в переводе обозначающее «многоапсидный»). С запада к церкви примыкает притвор (1222-1240 гг.), западный портал которого обрамляют горельефные изваяния символов-оберегов. У южных пределов комплекса расположилась небольшая купольная церковь «Кираки» (XIII в.), а восточнее находятся руины часовни, могильные плиты и изваяние большого «крылатого» хачкара, который по традиции считается надгробным камнем вардапета Ванакана.